為避免菌種因長(zhǎng)時(shí)間運(yùn)用，生活力降低，出現(xiàn)耳片發(fā)黃，不易開片，再生力差的毛病。依據(jù)出產(chǎn)的辦法選用不同菌齡、不同生理成熟度的銀耳菌株。如段木培養(yǎng)時(shí)，應(yīng)選菌齡小，成熟度低，銀耳氣生菌絲一白毛團(tuán)旺盛，不易膠質(zhì)化的菌株；瓶栽時(shí)，應(yīng)選菌嶺大，成熟度高，白毛團(tuán)小，簡(jiǎn)略膠質(zhì)化并易開片的菌株。香灰菌絲應(yīng)選爬壁力強(qiáng)，羽毛狀分枝長(zhǎng)的，分解木材能力強(qiáng)的菌株作為段木培養(yǎng)的菌株，而代料培養(yǎng)時(shí)，香灰菌絲要稍“弱化”一些的菌株才好，不然滿瓶、滿袋都是香灰菌絲，有限的養(yǎng)分都被香灰菌絲耗費(fèi)掉，銀耳反而長(zhǎng)不大。

原種儲(chǔ)藏的時(shí)間太長(zhǎng)，耳基很大，培育基的養(yǎng)料耗費(fèi)過甚，食用菌滅菌鍋爐菌種的生活力已闌珊，應(yīng)棄之不必。不然運(yùn)用作用還不如適齡的培養(yǎng)種再擴(kuò)展培育的菌種。

母種保存

母種應(yīng)儲(chǔ)藏在4-15℃的冰箱中。每1-3個(gè)月移植一次。原種若不馬上運(yùn)用，也應(yīng)保存在低溫、枯燥的場(chǎng)所。培養(yǎng)種滿瓶后至45天之內(nèi)就應(yīng)盡早地種下去。

銀耳純菌種長(zhǎng)時(shí)間獨(dú)自保藏，所長(zhǎng)的子實(shí)體有變黃的趨勢(shì)；而和“香灰”菌絲混合培育，并經(jīng)過長(zhǎng)時(shí)間保藏，子實(shí)體較不易變黃。為了得到雪白的銀耳，菌種應(yīng)從色澤皎白的銀耳（野生的或家生的）中進(jìn)行采種。保種3年以上就應(yīng)留意色澤的問題。